Teste COVID-19 de conversão de células T





Um teste de células T para COVID-19 sequencia o DNA dos TCRs de uma pessoa (azul escuro) para revelar se eles foram infectados .


Um teste de diagnóstico baseado no sequenciamento de células T de memória específica SARS-CoV-2 de longa duração fornece um complemento ao teste de anticorpos para determinar a exposição prévia ao SARS-CoV-2.

Após a autorização de uso emergencial da Food and Drug Administration (FDA) do mês passado para o teste T-Detect COVID-19 da Adaptive Biotechnologies, testes de células T de rotina entraram em uma nova era. O teste adaptável envolve sequenciamento de última geração baseado em laboratório para identificar células T que reconhecem antígenos SARS-CoV-2. O teste não se destina ao diagnóstico de infecção ativa, mas é um complemento aos testes de anticorpos utilizados para confirmar infecções recentes ou anteriores. O procedimento baseado em laboratório, que tem um tempo de reviravolta de sete a dez dias, agora está autorizado para uso em amostras colhidas de indivíduos pelo menos 15 dias após o início dos sintomas.

ncreasing interesse é focado no papel da imunidade de células T no combate à infecção sars-cov-2 e na resistência à re-infecção. Uma nova análise das células T de pessoas que se recuperaram do COVID-19 confirmou que elas permanecem ativas contra três das novas variantes SARS-CoV-2 de preocupação: B1.1.7, B.351 e B.1.1.248. O estudo, conduzido por uma equipe do Instituto Nacional de Alergia e Doenças Infecciosas dos EUA (NIAID), Johns Hopkins University School of Medicine, Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health e da empresa de biotecnologia ImmunoScape, com sede em Cingapura, aumentará ainda mais a confiança de que a eficácia das vacinas desenvolvidas contra a cepa pandêmica original não será excessivamente comprometida à medida que essas novas variantes — e outras — se espalharem mais amplamente.


Até agora, os pesquisadores têm confiado principalmente no uso de ensaios de fluxo lateral ou testes de ensaio imunossorbente ligados à enzima (ELISA) para anticorpos SARS-CoV-2 para determinar se uma pessoa foi exposta ao vírus. Entender a resposta de anticorpos neutralizantes tem sido considerado central para estabelecer proteção contra o vírus. "É fácil de testar", diz Andrew Redd, da NIAID, que liderou o estudo recente. Embora críticos, os anticorpos fazem parte de um conjunto maior e incompletamente compreendido de respostas imunes humorais e celulares, que tem recebido pouca atenção. Estes incluem funções adicionais de anticorpos, como citotoxicidade celular dependente de anticorpos, ativação complementar e recrutamento de fagocitos. Desvendar sua contribuição para a imunidade SARS-CoV-2 é um desafio contínuo. "Há ensaios para fazer isso, é complicado de fazer", diz Redd.

O mesmo pode ser dito para avaliar imunidade mediada por células T. O estudo niaid baseou-se em um teste laboratorial complexo para identificar epítopos de células T específicos do SARS-CoV-2, empregando uma combinação de citometria em massa e coloração combinatória de tetramers do complexo de histocompatibilidade (MHC) ligados ao peptídeo. A complexidade do ensaio e dos dados gerados limitam necessariamente o ensaio a ser utilizado em laboratórios especializados. "Os dados que ele gera são enormes. O lado da análise é um grande elevador", diz Redd.

O teste de sequenciamento de biotecnologia adaptativa fornece uma opção mais simples. Em um estudo de validação clínica,o ensaio T-Detect COVID alcançou 97,1% de sensibilidade (definida como concordância percentual positiva) e 100% de especificidade (definida como concordância percentual negativa) em comparação com os testes de PCR de 15 dias ou mais após o diagnóstico.

O teste surgiu de uma colaboração de longa data entre adaptive e microsoft para aplicar aprendizado de máquina para definir as "regras" de acordo com as quais receptores de células T (TCRs) identificam seus antígenos cognatos. Isso, combinado com a caracterização genômica extensiva dos repertórios de células T de pessoas infectadas com SARS-CoV-2, permitiu que adaptável definisse um amplo conjunto de TCRs que são indicativos de infecção com o vírus. O teste sequencia o repertório total de TCR presente em uma determinada amostra e, em seguida, calcula o enriquecimento relativo para TCRs sars-cov-2-2-específico em comparação com limiares predefinidos para determinar o resultado, levando em conta a variação nas respostas imunes dos indivíduos.


O teste do Adaptive analisa tanto a frequência quanto a distribuição dos TCRs presentes e as expansões clonais de células T que ocorreram. "O algoritmo leva em conta a amplitude e a profundidade clonais", diz Lance Baldo, diretor médico da Adaptive.

Métodos tradicionais de teste de células T, como o ponto imunossorbente ligado à enzima (ELISpot) e a coloração de citocinas intracelulares, exigem que os cientistas meçam diretamente a produção de citocinas das células T após a estimulação de antígenos em condições específicas. "As células vivas não se saem bem do corpo por muito tempo", diz Baldo. "Estamos olhando para o DNA genômico das células T, que é um analito muito estável." As amostras podem ser enviadas à temperatura ambiente e congeladas por longos períodos. O novo teste também é mais preciso do que os métodos tradicionais que só permitem que um pequeno número de antígenos de peptídeos seja medido simultaneamente. E como as respostas das células T duram mais do que as respostas de anticorpos, o teste também fornece uma janela mais ampla para estabelecer se um indivíduo foi ou não infectado.


Uma aplicação imediata do teste será monitorar a eficácia das diversas vacinas que estão sendo implantadas, especialmente em populações vulneráveis. "Ainda não sabemos quanto tempo a imunidade vai durar", diz Joaquín Martínez-Lopez, do Centro Nacional de Pesquisa do Câncer da Espanha, em Madri, que colaborou com a Adaptive no desenvolvimento do teste.

Qiagen, de Hilden, Alemanha, também está desenvolvendo um diagnóstico de células T baseados em sequenciamento de última geração, tendo assinado um acordo com a TScan Therapeutics, que lhe fornecerá acesso à propriedade intelectual deste último e dados associados para vários painéis de epítopos em SARS-CoV-2 que são reconhecidos por células CD8+ T de pacientes em recuperação do COVID-19. Os cientistas tscan identificaram de três a oito epítopos para cada um dos seis tipos mais comuns de antígenos leucócitos humanos em pessoas convalescendo do COVID-19.


Cite este artigo

Sheridan, C. COVID-19 testes se transformam em células T. Nat Biotechnol 39, 533-534 (2021 https://doi.org/10.1038/s41587-021-00920-9).

Citação de download

· Publicado em12 de maio de 2021

· Datada emissãomaio 2021

· DOIShttps://doi.org/10.1038/s41587-021-00920-9


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